Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCG3Q8WXD2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCG3Q8WXD2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms