Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSMCE1Q8WV22 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms