Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3RF2Q8TEC5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3RF2Q8TEC5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF2Q8TEC5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF2Q8TEC5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms