Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACBD4Q8NC06 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACBD4Q8NC06 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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