Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COLGALT1Q8NBJ5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COLGALT1Q8NBJ5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms