Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMER3Q8N944 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMER3Q8N944 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER3Q8N944 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMER3Q8N944 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms