Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1V2

CFAP52, Cilia- and flagella-associated protein 52, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP52Q8N1V2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CFAP52Q8N1V2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP52Q8N1V2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP52Q8N1V2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP52Q8N1V2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP52Q8N1V2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP52Q8N1V2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP52Q8N1V2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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