Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLF2Q8IX21 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLF2Q8IX21 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLF2Q8IX21 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLF2Q8IX21 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms