Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM48Q8IWZ4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM48Q8IWZ4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM48Q8IWZ4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM48Q8IWZ4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms