Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX29P2Q8IUI4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX29P2Q8IUI4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX29P2Q8IUI4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1662.7 ms