Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD3

TMEM25, Transmembrane protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM25Q86YD3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM25Q86YD3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM25Q86YD3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM25Q86YD3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM25Q86YD3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM25Q86YD3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM25Q86YD3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM25Q86YD3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM25Q86YD3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM25Q86YD3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM25Q86YD3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms