Protein–RNA interactions for Protein: Q86WK6

AMIGO1, Amphoterin-induced protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1Q86WK6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMIGO1Q86WK6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AMIGO1Q86WK6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AMIGO1Q86WK6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms