Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NPM2Q86SE8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NPM2Q86SE8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NPM2Q86SE8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NPM2Q86SE8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NPM2Q86SE8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NPM2Q86SE8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
NPM2Q86SE8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NPM2Q86SE8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms