Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
YTHDF3Q7Z739 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
YTHDF3Q7Z739 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.6 ms