Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z478

DHX29, ATP-dependent RNA helicase DHX29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX29Q7Z478 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
DHX29Q7Z478 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
DHX29Q7Z478 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
DHX29Q7Z478 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
DHX29Q7Z478 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
DHX29Q7Z478 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
DHX29Q7Z478 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
DHX29Q7Z478 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
DHX29Q7Z478 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
DHX29Q7Z478 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
DHX29Q7Z478 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
DHX29Q7Z478 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
DHX29Q7Z478 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
DHX29Q7Z478 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
DHX29Q7Z478 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
DHX29Q7Z478 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
DHX29Q7Z478 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
DHX29Q7Z478 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
DHX29Q7Z478 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
DHX29Q7Z478 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
DHX29Q7Z478 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
DHX29Q7Z478 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
DHX29Q7Z478 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
DHX29Q7Z478 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
DHX29Q7Z478 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
DHX29Q7Z478 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
DHX29Q7Z478 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
DHX29Q7Z478 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
DHX29Q7Z478 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
DHX29Q7Z478 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
DHX29Q7Z478 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
DHX29Q7Z478 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
DHX29Q7Z478 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
DHX29Q7Z478 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
DHX29Q7Z478 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
DHX29Q7Z478 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
DHX29Q7Z478 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
DHX29Q7Z478 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
DHX29Q7Z478 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
DHX29Q7Z478 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
DHX29Q7Z478 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
DHX29Q7Z478 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
DHX29Q7Z478 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
DHX29Q7Z478 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
DHX29Q7Z478 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms