Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RD3Q7Z3Z2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RD3Q7Z3Z2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RD3Q7Z3Z2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RD3Q7Z3Z2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms