Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
OTOP1Q7RTM1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
OTOP1Q7RTM1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
OTOP1Q7RTM1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
OTOP1Q7RTM1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
OTOP1Q7RTM1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms