Protein–RNA interactions for Protein: Q71RS6

SLC24A5, Sodium/potassium/calcium exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A5Q71RS6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC24A5Q71RS6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC24A5Q71RS6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC24A5Q71RS6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC24A5Q71RS6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC24A5Q71RS6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC24A5Q71RS6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC24A5Q71RS6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC24A5Q71RS6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC24A5Q71RS6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC24A5Q71RS6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC24A5Q71RS6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC24A5Q71RS6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC24A5Q71RS6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms