Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP43Q70EL4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP43Q70EL4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP43Q70EL4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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