Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM179Q6ZVK1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM179Q6ZVK1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM179Q6ZVK1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM179Q6ZVK1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms