Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TPGS1Q6ZTW0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPGS1Q6ZTW0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPGS1Q6ZTW0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 413.4 ms