Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG6

BRAT1, BRCA1-associated ATM activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAT1Q6PJG6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRAT1Q6PJG6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRAT1Q6PJG6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRAT1Q6PJG6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms