Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFWD3Q6PCD5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFWD3Q6PCD5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms