Protein–RNA interactions for Protein: Q6P0N0

MIS18BP1, Mis18-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18BP1Q6P0N0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIS18BP1Q6P0N0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIS18BP1Q6P0N0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIS18BP1Q6P0N0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIS18BP1Q6P0N0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIS18BP1Q6P0N0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MIS18BP1Q6P0N0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MIS18BP1Q6P0N0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MIS18BP1Q6P0N0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MIS18BP1Q6P0N0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18BP1Q6P0N0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18BP1Q6P0N0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18BP1Q6P0N0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18BP1Q6P0N0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18BP1Q6P0N0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18BP1Q6P0N0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18BP1Q6P0N0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIS18BP1Q6P0N0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MIS18BP1Q6P0N0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MIS18BP1Q6P0N0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MIS18BP1Q6P0N0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MIS18BP1Q6P0N0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MIS18BP1Q6P0N0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 662.8 ms