Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAVIN1Q6NZI2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAVIN1Q6NZI2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms