Protein–RNA interactions for Protein: Q659A1

ICE2, Little elongation complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE2Q659A1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ICE2Q659A1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ICE2Q659A1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ICE2Q659A1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ICE2Q659A1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ICE2Q659A1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ICE2Q659A1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ICE2Q659A1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ICE2Q659A1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms