Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WSCD1Q658N2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
WSCD1Q658N2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WSCD1Q658N2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
WSCD1Q658N2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms