Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DENND4CQ5VZ89 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DENND4CQ5VZ89 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND4CQ5VZ89 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms