Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.09■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
C9orf84Q5VXU9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
C9orf84Q5VXU9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
C9orf84Q5VXU9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
C9orf84Q5VXU9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
C9orf84Q5VXU9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
C9orf84Q5VXU9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
C9orf84Q5VXU9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
C9orf84Q5VXU9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
C9orf84Q5VXU9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
C9orf84Q5VXU9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
C9orf84Q5VXU9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
C9orf84Q5VXU9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
C9orf84Q5VXU9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
C9orf84Q5VXU9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
C9orf84Q5VXU9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
C9orf84Q5VXU9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
C9orf84Q5VXU9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
C9orf84Q5VXU9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
C9orf84Q5VXU9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
C9orf84Q5VXU9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
C9orf84Q5VXU9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.97■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
C9orf84Q5VXU9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.93■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.89■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
C9orf84Q5VXU9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
C9orf84Q5VXU9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
C9orf84Q5VXU9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
C9orf84Q5VXU9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
C9orf84Q5VXU9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
C9orf84Q5VXU9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
C9orf84Q5VXU9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
C9orf84Q5VXU9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
C9orf84Q5VXU9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
C9orf84Q5VXU9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
C9orf84Q5VXU9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
C9orf84Q5VXU9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms