Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
FOCADQ5VW36 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOCADQ5VW36 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms