Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRCH2Q5VUJ6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRCH2Q5VUJ6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRCH2Q5VUJ6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRCH2Q5VUJ6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRCH2Q5VUJ6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRCH2Q5VUJ6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRCH2Q5VUJ6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRCH2Q5VUJ6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRCH2Q5VUJ6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRCH2Q5VUJ6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRCH2Q5VUJ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRCH2Q5VUJ6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRCH2Q5VUJ6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRCH2Q5VUJ6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRCH2Q5VUJ6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms