Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCO4Q5TGY1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCO4Q5TGY1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCO4Q5TGY1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCO4Q5TGY1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCO4Q5TGY1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCO4Q5TGY1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCO4Q5TGY1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCO4Q5TGY1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCO4Q5TGY1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCO4Q5TGY1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCO4Q5TGY1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO4Q5TGY1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO4Q5TGY1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO4Q5TGY1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCO4Q5TGY1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMCO4Q5TGY1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO4Q5TGY1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms