Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HES3Q5TGS1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HES3Q5TGS1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms