Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC9C2Q5TAH2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC9C2Q5TAH2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC9C2Q5TAH2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC9C2Q5TAH2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms