Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFAP70Q5T0N1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CFAP70Q5T0N1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CFAP70Q5T0N1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CFAP70Q5T0N1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CFAP70Q5T0N1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CFAP70Q5T0N1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CFAP70Q5T0N1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CFAP70Q5T0N1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CFAP70Q5T0N1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CFAP70Q5T0N1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFAP70Q5T0N1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFAP70Q5T0N1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFAP70Q5T0N1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFAP70Q5T0N1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFAP70Q5T0N1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFAP70Q5T0N1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CFAP70Q5T0N1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CFAP70Q5T0N1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CFAP70Q5T0N1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFAP70Q5T0N1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFAP70Q5T0N1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFAP70Q5T0N1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFAP70Q5T0N1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFAP70Q5T0N1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CFAP70Q5T0N1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFAP70Q5T0N1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms