Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SBK1Q52WX2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SBK1Q52WX2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SBK1Q52WX2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SBK1Q52WX2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SBK1Q52WX2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SBK1Q52WX2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SBK1Q52WX2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SBK1Q52WX2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SBK1Q52WX2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SBK1Q52WX2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SBK1Q52WX2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SBK1Q52WX2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SBK1Q52WX2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SBK1Q52WX2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SBK1Q52WX2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SBK1Q52WX2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SBK1Q52WX2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SBK1Q52WX2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SBK1Q52WX2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SBK1Q52WX2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SBK1Q52WX2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SBK1Q52WX2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SBK1Q52WX2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SBK1Q52WX2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SBK1Q52WX2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms