Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIQ3

KIF4B, Chromosome-associated kinesin KIF4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4BQ2VIQ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF4BQ2VIQ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
KIF4BQ2VIQ3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KIF4BQ2VIQ3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KIF4BQ2VIQ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KIF4BQ2VIQ3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KIF4BQ2VIQ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KIF4BQ2VIQ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KIF4BQ2VIQ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KIF4BQ2VIQ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIF4BQ2VIQ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIF4BQ2VIQ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIF4BQ2VIQ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIF4BQ2VIQ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
KIF4BQ2VIQ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KIF4BQ2VIQ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KIF4BQ2VIQ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KIF4BQ2VIQ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms