Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPROQ16827 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPROQ16827 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPROQ16827 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
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