Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NRF1Q16656 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRF1Q16656 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRF1Q16656 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NRF1Q16656 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRF1Q16656 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRF1Q16656 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRF1Q16656 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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