Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NTRK2Q16620 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NTRK2Q16620 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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