Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LAMA4Q16363 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMA4Q16363 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
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