Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNHIT3Q15649 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNHIT3Q15649 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNHIT3Q15649 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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