Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRKQ15262 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PTPRKQ15262 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PTPRKQ15262 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPRKQ15262 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
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