Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRRQ15256 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRRQ15256 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
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