Protein–RNA interactions for Protein: Q15061

WDR43, WD repeat-containing protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR43Q15061 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.122e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.042e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.942e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.62e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.222e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.122e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.032e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 YWHAZ-223ENST00000523938 626 ntTSL 526.48■■□□□ 1.832e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 YWHAZ-221ENST00000523131 567 ntTSL 526.39■■□□□ 1.822e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.792e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 SPN-205ENST00000563039 1853 ntTSL 525.89■■□□□ 1.742e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.78e-7■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 YWHAZ-208ENST00000418997 996 ntTSL 225.57■■□□□ 1.682e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 YWHAZ-210ENST00000437293 701 ntTSL 325.34■■□□□ 1.652e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 FAM229A-202ENST00000416512 2759 ntTSL 1 (best)25.24■■□□□ 1.632e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.532e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.482e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.442e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 BBC3-206ENST00000601438 1747 nt23.84■■□□□ 1.412e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.362e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.32e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.252e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 YWHAZ-215ENST00000518736 883 ntTSL 322.75■■□□□ 1.232e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 MFGE8-205ENST00000558018 1989 ntTSL 222.56■■□□□ 1.22e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.192e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.182e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 KDM4B-210ENST00000592175 562 ntTSL 421.56■■□□□ 1.042e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.982e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC20.95■□□□□ 0.942e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.932e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 FAM229A-201ENST00000415596 446 ntTSL 320.43■□□□□ 0.862e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.752e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 SLC39A7-204ENST00000463972 1410 ntTSL 217.95■□□□□ 0.462e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.42e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 HERC1-214ENST00000561400 2215 ntTSL 215.46■□□□□ 0.072e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 YWHAZ-207ENST00000395958 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -02e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 LINC01033-201ENST00000504609 735 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.062e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 YWHAZ-216ENST00000521309 1399 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.182e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 YWHAZ-212ENST00000480304 2247 ntTSL 213.71□□□□□ -0.212e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 YWHAZ-217ENST00000521328 511 ntTSL 513.5□□□□□ -0.252e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 AP000561.1-201ENST00000444130 435 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.322e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 YWHAZ-202ENST00000395948 812 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.392e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 HERC1-209ENST00000560519 591 ntTSL 312.51□□□□□ -0.412e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.742e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.762e-6■■■□□ 15.7
WDR43Q15061 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.534e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.474e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.384e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.184e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 PRKRIP1-207ENST00000482549 1625 ntTSL 1 (best)33.86■■■■□ 3.019e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 SYNGAP1-206ENST00000479510 2073 ntTSL 232.52■■■□□ 2.89e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 PRKRIP1-204ENST00000469763 1642 ntTSL 532.01■■■□□ 2.729e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 FDFT1-203ENST00000446331 1558 ntTSL 231.67■■■□□ 2.669e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 PRKRIP1-205ENST00000477886 986 ntTSL 1 (best)31.18■■■□□ 2.589e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.29e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.149e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 VARS-218ENST00000459667 793 ntTSL 327.48■■□□□ 1.999e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 VARS-224ENST00000479051 612 ntTSL 327.21■■□□□ 1.959e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.919e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 ABHD17A-203ENST00000588598 5425 ntTSL 226.52■■□□□ 1.849e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.839e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 SYNGAP1-227ENST00000638142 2499 ntTSL 526.48■■□□□ 1.839e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.786e-7■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.789e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 KCNH2-204ENST00000461280 2430 ntTSL 1 (best)25.56■■□□□ 1.689e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.679e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 TSSC2-206ENST00000533775 1210 ntTSL 525.4■■□□□ 1.669e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.649e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.639e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 FDFT1-207ENST00000525607 1773 ntTSL 225.18■■□□□ 1.629e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.629e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.619e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 BUD23-206ENST00000430270 1260 ntTSL 524.84■■□□□ 1.579e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.569e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.569e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.529e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.469e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.459e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.459e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 BTNL9-206ENST00000511056 332 ntTSL 324.11■■□□□ 1.459e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 ABHD17A-205ENST00000591351 4647 ntTSL 223.93■■□□□ 1.429e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 KCNH2-206ENST00000532957 3374 ntTSL 223.86■■□□□ 1.419e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 KCNH2-205ENST00000473610 2782 ntTSL 223.65■■□□□ 1.389e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 FDFT1-217ENST00000530337 741 ntTSL 323.06■■□□□ 1.289e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.279e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.259e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.249e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.179e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.119e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 BTNL9-203ENST00000491209 2199 ntTSL 221.79■■□□□ 1.089e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.076e-7■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 VARS-216ENST00000428445 863 ntTSL 521.59■■□□□ 1.059e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.049e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.989e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.949e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 PRKRIP1-206ENST00000482465 2257 ntTSL 220.93■□□□□ 0.949e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.896e-7■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.889e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 TSSC2-202ENST00000526284 1244 ntTSL 1 (best)20.38■□□□□ 0.859e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.829e-6■■■□□ 15.6
Retrieved 100 of 3,951 protein–RNA pairs in 30.1 ms