Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHD4Q14839 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHD4Q14839 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CHD4Q14839 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHD4Q14839 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
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