Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPIDRQ14159 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPIDRQ14159 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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SPIDRQ14159 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPIDRQ14159 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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