Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF2H3Q13889 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF2H3Q13889 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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