Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC2Q13868 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC2Q13868 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC2Q13868 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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