Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNASE1L3Q13609 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNASE1L3Q13609 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DNASE1L3Q13609 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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